Для начала останавливаем apache, чтобы не мешался пока суть, да дело:

/etc/init.d/apache2 stop

Сносим всё PHP которое установлено:

apt-get remove php5-cli php5-common php5-suhosin php5-mcrypt php5-mysql php5-gd php5-dev php-pear php5-curl php-apc php5-memcache php5-fpm
apt-get autoremove

Лезем в конфигурационный файл /etс/apt/sources.list стираем там 2 старые строки посвященные dotdeb.org и вместо них вписываем такие:

deb http://packages.dotdeb.org squeeze-php54 all
deb-src http://packages.dotdeb.org squeeze-php54 all

Обновляемся:

apt-get update

И ставим всё новое:

apt-get install php5-cli php5-common php5-mcrypt php5-mysql php5-gd php5-dev php-pear php5-curl php5-apc php5-memcache php5-fpm
apt-get autoremove

• php5-suhosin для PHP 5.4 не нужен и не рекомендован.
• APC берём тоже с dotdeb, поэтому пакет называется php5-apc, a не php-apc как раньше.
• По ходу дела пару раз спросят что делать с конфигами (php.ini и т.п.)- решайте сами. Можно оставить старые, можно взять новые из устанавливаемых пакетов, можно посмотреть различия. Я советую ставить новые, хотя это и означает что все изменения которые в них вносились придётся делать заново

Если вы установили новые конфиги, то вносим в них изменения упомянутые в «Часть VI.PHP». Номера строк в конфигах будут другие. На всякий случай перечисляю директивы, на которые необходимо обратить внимание.
/etc/php5/fpm/php.ini:

expose_php
mail.add_x_header
sendmail_path
disable_functions
error_log
session.save_path

/etc/php5/fpm/pool.d/www.conf:

listen
pm.max_children
pm.start_servers
pm.min_spare_servers
pm.max_spare_servers
pm.max_requests

/etc/php5/cli/php.ini:

expose_php
mail.add_x_header
sendmail_path

Теперь правим конфигурации apache (потому что эти нехорошие люди, по неведомым причинам, переименовали /usr/sbin/php-fpm в /usr/sbin/php5-fpm ). Итак, в /etc/apache2/sites-available/superls.ru находим и правим две строки:
Было:

Action php-fastcgi /usr/sbin/php-fpm.fcgi  
ScriptAlias /usr/sbin/php-fpm.fcgi /usr/sbin/php-fpm

Cтало:

Action php-fastcgi /usr/sbin/php5-fpm.fcgi  
ScriptAlias /usr/sbin/php5-fpm.fcgi /usr/sbin/php5-fpm

Далее в /etc/apache2/mods-available/fastcgi.conf меняем строку:
Было:

FastCGIExternalServer /usr/sbin/php-fpm -socket /var/run/php5-fpm.socket -idle-timeout 30

Cтало:

FastCGIExternalServer /usr/sbin/php5-fpm -socket /var/run/php5-fpm.socket -idle-timeout 30

Cтартуем всё:

/etc/init.d/php5-fpm restart
/etc/init.d/apache2 start

Автор Gmugra mmozg.net