ISPmanager'у он не мешает
Регистрируемся в Dropbox
Устанавливаем консольный клиент:

cd ~/
wget -O dropbox.tar.gz http://www.dropbox.com/download/?plat=lnx.x86_64
tar -zxof dropbox.tar.gz

или для «обычной» 32 битной системы:

cd ~/
wget -O dropbox.tar.gz http://www.dropbox.com/download/?plat=lnx.x86
tar -zxof dropbox.tar.gz

Запускаем клиент:

~/.dropbox-dist/dropboxd

Через несколько секунд в консоле появится ссылка для привязки сервера к вашему аккаунту на dropbox.com
Пройдите по ссылке.
Создаем скрипт автозапуска /etc/init.d/dropbox

wget -P /etc/init.d http://dl.dropbox.com/u/37472737/dropbox

Делаем исполняемым, разрешаем запуск при загрузке и запускаем:

chmod +x /etc/init.d/dropbox
update-rc.d dropbox defaults
/etc/init.d/dropbox start

В ISPmanager в «Настройка резервного копирования» создаем новое задание, вводим все на свои усмотрения.
Директория: /root/Dropbox/backup
Выделяем задание и выбираем «Данные» (справа, вверху) и настраиваем на свое усмотрение.

Проверяем работу:

/etc/init.d/dropbox status

если выдает ошибку (что маловероятно, но у меня была), то выполните команду

~/.dropbox-dist/dropboxd &

Dropbox теперь будет синхронизировать ваши резервные копии.