Настраиваем форму поиска Яндекса site.yandex.ru/new_info.xml
Выбираем «оформление результатов поиска — в iframe странице» и пишем желаемый адрес страницы результатов поиска, например yoursite.ru/page/poisk

Копируем полученный html-код поисковой формы и вставляем его в sidebar.tpl вместо строк

<div class="block">
        <form action="{router page='search'}topics/" method="GET">
        <input class="text" type="text" onblur="if (!value) value=defaultValue" onclick="if (value==defaultValue) value=''" value="{$aLang.search}" name="q" />
        <input class="button" type="submit" value="{$aLang.search_submit}" />
        </form>
</div>

заключаем этот код в тег {literal}{/literal}

Создаем статическую страницу poisk(или же через запись, не суть важно). Для этого нужно активировать плагин static page. В поле «Текст» новой страницы снова вставляем код поисковой формы и затем второй код от Яндекса, примерно такой:

<div id="yandex-results-outer" onclick="return {encoding: ''}"></div>
<script type="text/javascript" src="http://site.yandex.net/load/site.js" charset="utf-8"></script>

Если с css проблемы.
в начале кода, в редакторе статической страницы

<div class="yandexform" style="width: 960px;" onclick="return {type: 2, logo: 'rb', arrow: false, webopt: false, websearch: false, bg: '#CCE5FF', fg: '#000000', fontsize: 14, suggest: true, site_suggest: true, encoding: ''}">