Куда устанавливать шаблон?

Папку шаблона копируют в каталог /templates/skin/, потом задают имя шаблона (совпадает с именем папки каталога) в файле /config/config.php или (предпочтительно) в файле /config/config.local.php в строке:

$config['view']['skin'] = 'synio'; // где "synio" - имя шаблона, совпадает с папкой шаблона

если в файле config.local.php такой строки нету — следует её добавить перед строкой:

return $config;

Что делать, когда в файлах шаблона/движка такая ересь?

1. Редактировать файлы только через программу notepad.abcd.bz
2. Выбирать кодировку UTF-8 without BOM

и почистить папку cache
например можно просто переименовать папку, добавить любой символ. создастся новая кеш папка стиля ;) а старую удалите.